Fakultas Ekonomi dan Bisnis, Universitas Papua memiliki 3 Prodi untuk S1:

1. Prodi Management
2. Prodi Akuntansi
3. Prodi Ekonomi Pembangunan

Fakultas Ekonomi dan Bisnis, Universitas Papua memiliki 1 Produ untuk S2:

1. Prodi Ekonomi Pembangunan